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次世代シーケンスを使用する研究者, 病原体を迅速に特定するためのその他の新しい方法

月曜日, 7 月 28 日, 2014



マンハッタン — 彼は自分自身をバグハンターと呼んでいます, しかし、彼の研究のターゲットは、特別な方法と機器でのみ発見および識別できるブックメーカー おすすめで構成されています. ベンジャミン・ハウス, 大学の助教授) ブックメーカー おすすめ獣医診断研究所 ブックメーカー おすすめにて, 最近、彼の発見の 1 つに関する記事を公開しました, ブタエンテロウイルス G, これは米国での重要な発見です.

「細胞内のブックメーカー おすすめを分離しました, でもそれが何なのかは分かりませんでした,「ハウゼは言いました. 「私たちはそれを特定するために次世代配列決定を使用しました, そしてそれはブタエンテロブックメーカー おすすめGであることが判明, これまでに記載されていたが、北米ではこれまで発見されていなかった."

ブックメーカー おすすめは良性であると考えられており、病気を引き起こすことは知られていません, しかし以前はヨーロッパとアジアでしか報告されていなかった.

「幸いなことに、ブタエンテロブックメーカー おすすめ G はブタにはあまり影響を与えません, しかし、他のブックメーカー おすすめが国境を越えて侵入するのではないかという懸念が生じます,「ハウゼは言いました. 「これがしばらくの間検出されずにここに存在していたのか、それとも最近導入されたのかはわかりません. 偶然にも, このブックメーカー おすすめは 2012 年に中国で分離されたブックメーカー おすすめに最も類似しており、他のいくつかのブックメーカー おすすめとほぼ同時期に検出されました:豚流行性下痢ブックメーカー おすすめと豚デルタコロナブックメーカー おすすめ, 両方とも米国より前の同じ時期に中国で検出された.S."

豚流行性下痢ウイルスと豚デルタコロナウイルスはどちらも、北米の養豚生産者に多大な経済的損失を引き起こし、養豚産業の他のいくつかの側面に影響を与えている. ハウゼ博士は、病原体の特定と特徴付けに使用する次世代配列決定法の信頼性を確保する方法として、ブックメーカー おすすめ獣医診断研究所でこれらのウイルスのマッピングを行った. この技術はまもなく研究所で提供される予定です.

「ブックメーカー おすすめを隔離中, 私たちは彼らのゲノムを完全に解読できます,「ハウゼは言いました. 「これらのブックメーカー おすすめがなぜ感染するのかをよく理解できます. 次世代シーケンスはさらに進化し、ブックメーカー おすすめを分離せずにメタゲノムシーケンスを実行できるようになります. 代わりに, サンプルに含まれるすべての DNA を配列決定できます, これには宿主 DNA が含まれます, さらに、サンプル内のすべてのブックメーカー おすすめも読み取ります. これはブックメーカー おすすめを検出するための普遍的な方法であり、当社が獣医診断に応用したものです."

ハウスの最新の研究により、牛のインフルエンザブックメーカー おすすめが発見されました.

「インフルエンザと思われる豚のサンプルが入ってきた, しかし他の検査はすべて陰性でした,「ハウゼは言いました. 「代わりに、これはまったく新しいタイプのインフルエンザであることがわかりました. その後の研究により、牛に蔓延していることが判明しました, 豚だけじゃない. 私たちは現在、この株の牛インフルエンザと飼養場における呼吸器疾患との関連を研究中です."

5月にブックメーカー おすすめに入学する前, ハウゼはワーシントンのニューポート研究所の診断研究所所長でした, ミネソタ. 彼はブタエンテロウイルスGの論文に取り組みました リヒャルト・ヘッセ, ブックメーカー おすすめ獣医診断研究所の診断ウイルス学者, 次世代配列決定手法をさらに開発するためにハウゼを大学に採用するのに貢献した人, 病原体の特定と特徴付けによる他の利点もあります.

「ブックメーカー おすすめが突然変異し、変化するにつれて, 次世代シーケンスを使用してワクチンを更新し、効果を維持できる,「ハウゼは言いました. 「この技術を通じて、ブックメーカー おすすめがどこから来たのか、どのような臨床症状が見られたのかに基づいてブックメーカー おすすめのコレクションを含むデータベースを構築できます. その後、そのデータセットをマイニングしてワクチンと一致させたり、病原体に関する追加情報を取得したりできます. インフルエンザなどの一部の病気は突然変異し、急速に変化します, 人間から豚に飛び移り、また人間に戻ることもできる, したがって、これらのブックメーカー おすすめをできる限り監視し、理解することが動物の健康と人間の健康の両方にとって重要です."

ブタエンテロブックメーカー おすすめ G に関する記事, 「米国におけるブタエンテロブックメーカー おすすめ G の最初の同定と特性評価," が雑誌 PLOS ONE に掲載されました, http://bit.ly/1t3IfzL.

ソース

ベンジャミン・ハウス
785-532-4278
bhause@vet.k-ステート.教育

ウェブサイト

ブックメーカー おすすめ獣医診断研究所

写真

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Benjamin Hause

ベンジャミン ハウゼがブックメーカー おすすめ獣医診断研究所に研究助教授として加わりました. ハウスは次世代シークエンシングとその他の新しい手法を使用して病原体を迅速に特定.

作者

ジョー・モンゴメリー
785-532-4193
jmontgom@vet.k-ステート.教育

概要

ベンジャミン・ハウス, ブックメーカー おすすめカンザス州獣医診断研究所の助教授, 最近、彼の発見の 1 つに関する記事を公開しました, ブタエンテロウイルス G, これは米国での重要な発見です.